Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubb6Q922F4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tubb6Q922F4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms