Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf6Q91YR7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prpf6Q91YR7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms