Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmco4Q91WU4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmco4Q91WU4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms