Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK0

Tmem30a, Cell cycle control protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30aQ8VEK0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem30aQ8VEK0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem30aQ8VEK0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem30aQ8VEK0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem30aQ8VEK0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem30aQ8VEK0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem30aQ8VEK0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms