Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ankrd49Q8VE42 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd49Q8VE42 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd49Q8VE42 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd49Q8VE42 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms