Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Slc6a20aQ8VDB9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Slc6a20aQ8VDB9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Slc6a20aQ8VDB9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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