Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc8Q8VD72 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc8Q8VD72 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms