Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ApobrQ8VBT6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ApobrQ8VBT6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ApobrQ8VBT6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ApobrQ8VBT6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms