Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Afg3l2Q8JZQ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Afg3l2Q8JZQ2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Afg3l2Q8JZQ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Afg3l2Q8JZQ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Afg3l2Q8JZQ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Afg3l2Q8JZQ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Afg3l2Q8JZQ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Afg3l2Q8JZQ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Afg3l2Q8JZQ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms