Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGZ0

Cherp, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CherpQ8CGZ0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CherpQ8CGZ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CherpQ8CGZ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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