Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CcinQ8CDE2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcinQ8CDE2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcinQ8CDE2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms