Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Phf20l1Q8CCJ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Phf20l1Q8CCJ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phf20l1Q8CCJ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms