Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AtripQ8BMG1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AtripQ8BMG1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AtripQ8BMG1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms