Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chn2Q80XD1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chn2Q80XD1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chn2Q80XD1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chn2Q80XD1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chn2Q80XD1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms