Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcdh8Q7TSK3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh8Q7TSK3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh8Q7TSK3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms