Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nphp3Q7TNH6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nphp3Q7TNH6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp3Q7TNH6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms