Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med16Q6PGF3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med16Q6PGF3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Med16Q6PGF3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms