Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrig3Q6P1C6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrig3Q6P1C6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrig3Q6P1C6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms