Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NipblQ6KCD5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NipblQ6KCD5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms