Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Knl1Q66JQ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Knl1Q66JQ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Knl1Q66JQ7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Knl1Q66JQ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms