Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SkiQ60698 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SkiQ60698 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SkiQ60698 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SkiQ60698 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SkiQ60698 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SkiQ60698 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SkiQ60698 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SkiQ60698 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SkiQ60698 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SkiQ60698 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SkiQ60698 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms