Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Akap4Q60662 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Akap4Q60662 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Akap4Q60662 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Akap4Q60662 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Akap4Q60662 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Akap4Q60662 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Akap4Q60662 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Akap4Q60662 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Akap4Q60662 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Akap4Q60662 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Akap4Q60662 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Akap4Q60662 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Akap4Q60662 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Akap4Q60662 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms