Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtp3Q5QGU6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtp3Q5QGU6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtp3Q5QGU6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtp3Q5QGU6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtp3Q5QGU6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtp3Q5QGU6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms