Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
1810065E05RikQ5NC41 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
1810065E05RikQ5NC41 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
1810065E05RikQ5NC41 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms