Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DroshaQ5HZJ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DroshaQ5HZJ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DroshaQ5HZJ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
DroshaQ5HZJ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DroshaQ5HZJ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DroshaQ5HZJ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DroshaQ5HZJ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DroshaQ5HZJ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
DroshaQ5HZJ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
DroshaQ5HZJ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DroshaQ5HZJ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DroshaQ5HZJ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DroshaQ5HZJ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DroshaQ5HZJ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DroshaQ5HZJ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DroshaQ5HZJ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DroshaQ5HZJ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DroshaQ5HZJ0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DroshaQ5HZJ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DroshaQ5HZJ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DroshaQ5HZJ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DroshaQ5HZJ0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms