Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bbof1Q3V079 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bbof1Q3V079 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bbof1Q3V079 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.2 ms