Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zscan4fQ3URS2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zscan4fQ3URS2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms