Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Plxnd1Q3UH93 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plxnd1Q3UH93 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms