Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
Plxnd1Q3UH93 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Plxnd1Q3UH93 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Plxnd1Q3UH93 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Plxnd1Q3UH93 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Plxnd1Q3UH93 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Plxnd1Q3UH93 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Plxnd1Q3UH93 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Plxnd1Q3UH93 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Plxnd1Q3UH93 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Plxnd1Q3UH93 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Plxnd1Q3UH93 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Plxnd1Q3UH93 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Plxnd1Q3UH93 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Plxnd1Q3UH93 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Plxnd1Q3UH93 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Plxnd1Q3UH93 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Plxnd1Q3UH93 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Plxnd1Q3UH93 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Plxnd1Q3UH93 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Plxnd1Q3UH93 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Plxnd1Q3UH93 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Plxnd1Q3UH93 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Plxnd1Q3UH93 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Plxnd1Q3UH93 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Plxnd1Q3UH93 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Plxnd1Q3UH93 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Plxnd1Q3UH93 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Plxnd1Q3UH93 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Plxnd1Q3UH93 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Plxnd1Q3UH93 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Plxnd1Q3UH93 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Plxnd1Q3UH93 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Plxnd1Q3UH93 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Plxnd1Q3UH93 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Plxnd1Q3UH93 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Plxnd1Q3UH93 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Plxnd1Q3UH93 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Plxnd1Q3UH93 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Plxnd1Q3UH93 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Plxnd1Q3UH93 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Plxnd1Q3UH93 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Plxnd1Q3UH93 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Plxnd1Q3UH93 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Plxnd1Q3UH93 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Plxnd1Q3UH93 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Plxnd1Q3UH93 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Plxnd1Q3UH93 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Plxnd1Q3UH93 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Plxnd1Q3UH93 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Plxnd1Q3UH93 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Plxnd1Q3UH93 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Plxnd1Q3UH93 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Plxnd1Q3UH93 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Plxnd1Q3UH93 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Plxnd1Q3UH93 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Plxnd1Q3UH93 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Plxnd1Q3UH93 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Plxnd1Q3UH93 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Plxnd1Q3UH93 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Plxnd1Q3UH93 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Plxnd1Q3UH93 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Plxnd1Q3UH93 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Plxnd1Q3UH93 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Plxnd1Q3UH93 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Plxnd1Q3UH93 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Plxnd1Q3UH93 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Plxnd1Q3UH93 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Plxnd1Q3UH93 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Plxnd1Q3UH93 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Plxnd1Q3UH93 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Plxnd1Q3UH93 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Plxnd1Q3UH93 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Plxnd1Q3UH93 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Plxnd1Q3UH93 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Plxnd1Q3UH93 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plxnd1Q3UH93 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Plxnd1Q3UH93 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Plxnd1Q3UH93 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Plxnd1Q3UH93 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plxnd1Q3UH93 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plxnd1Q3UH93 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Plxnd1Q3UH93 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plxnd1Q3UH93 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plxnd1Q3UH93 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Plxnd1Q3UH93 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Plxnd1Q3UH93 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Plxnd1Q3UH93 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Plxnd1Q3UH93 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Plxnd1Q3UH93 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Plxnd1Q3UH93 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plxnd1Q3UH93 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Plxnd1Q3UH93 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Plxnd1Q3UH93 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Plxnd1Q3UH93 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plxnd1Q3UH93 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plxnd1Q3UH93 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Plxnd1Q3UH93 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Plxnd1Q3UH93 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plxnd1Q3UH93 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms