Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srebf2Q3U1N2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srebf2Q3U1N2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srebf2Q3U1N2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srebf2Q3U1N2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms