Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TTL0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3TTL0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3TTL0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3TTL0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3TTL0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTL0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3TTL0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3TTL0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3TTL0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3TTL0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3TTL0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms