Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Shroom4Q1W617 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Shroom4Q1W617 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Shroom4Q1W617 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Shroom4Q1W617 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Shroom4Q1W617 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
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