Protein–RNA interactions for Protein: Q19LI2

A1bg, Alpha-1B-glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1bgQ19LI2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A1bgQ19LI2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1bgQ19LI2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1bgQ19LI2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
A1bgQ19LI2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1bgQ19LI2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1bgQ19LI2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1bgQ19LI2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1bgQ19LI2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1bgQ19LI2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1bgQ19LI2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1bgQ19LI2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1bgQ19LI2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1bgQ19LI2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1bgQ19LI2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A1bgQ19LI2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A1bgQ19LI2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms