Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam47cQ14BE7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam47cQ14BE7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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