Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 AMN1YBR158W 1650 nt10.02□□□□□ -0.81
TY2B-BQ12491 AAT2YLR027C 1257 nt10.01□□□□□ -0.81
TY2B-BQ12491 YHR020WYHR020W 2067 nt10.01□□□□□ -0.81
TY2B-BQ12491 YPL257WYPL257W 582 nt10□□□□□ -0.81
TY2B-BQ12491 YDL177CYDL177C 513 nt9.99□□□□□ -0.81
TY2B-BQ12491 STT3YGL022W 2157 nt9.99□□□□□ -0.81
TY2B-BQ12491 MAK31YCR020C-A 267 nt9.98□□□□□ -0.81
TY2B-BQ12491 FAL1YDR021W 1200 nt9.98□□□□□ -0.81
TY2B-BQ12491 GON7YJL184W 372 nt9.98□□□□□ -0.81
TY2B-BQ12491 YET3YDL072C 612 nt9.97□□□□□ -0.81
TY2B-BQ12491 MDE1YJR024C 735 nt9.97□□□□□ -0.81
TY2B-BQ12491 CEM1YER061C 1329 nt9.97□□□□□ -0.81
TY2B-BQ12491 RPE1YJL121C 717 nt9.96□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 TUF1YOR187W 1314 nt9.95□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 ATG36YJL185C 882 nt9.95□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 TMA46YOR091W 1038 nt9.95□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 YBR241CYBR241C 1467 nt9.95□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 CDC19YAL038W 1503 nt9.95□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 SUF16tG(GCC)C 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 SUF20tG(GCC)F1 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 SUF23tG(GCC)J2 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 SUF17tG(GCC)O2 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 MTC2YKL098W 1074 nt9.94□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 CTF19YPL018W 1110 nt9.93□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 AMD2YDR242W 1650 nt9.93□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 MIX17YMR002W 471 nt9.93□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 TDP1YBR223C 1635 nt9.92□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 CCC2YDR270W 3015 nt9.9□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 RPS5YJR123W 678 nt9.9□□□□□ -0.82
TY2B-BQ12491 MRPL28YDR462W 444 nt9.89□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 YJR154WYJR154W 1041 nt9.89□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 SKS1YPL026C 1509 nt9.89□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 ADY2YCR010C 852 nt9.88□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 RPP1YHR062C 882 nt9.88□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 YJR146WYJR146W 354 nt9.88□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 SSP120YLR250W 705 nt9.88□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 GTO3YMR251W 1101 nt9.88□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 ISN1YOR155C 1353 nt9.87□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 RUF23RUF23 254 nt9.86□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 RFS1YBR052C 633 nt9.86□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 HST3YOR025W 1344 nt9.86□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 PAC2YER007W 1557 nt9.86□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 MAL31YBR298C 1845 nt9.85□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 HRQ1YDR291W 3234 nt9.84□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 RHB1YCR027C 630 nt9.84□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 YJR084WYJR084W 1272 nt9.84□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 FLC2YAL053W 2352 nt9.84□□□□□ -0.83
TY2B-BQ12491 PPT1YGR123C 1542 nt9.83□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 PRS2YER099C 957 nt9.83□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 CRF1YDR223W 1404 nt9.82□□□□□ -0.84
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TY2B-BQ12491 COX10YPL172C 1389 nt9.82□□□□□ -0.84
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TY2B-BQ12491 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt9.81□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 JNM1YMR294W 1122 nt9.81□□□□□ -0.84
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TY2B-BQ12491 YKR018CYKR018C 2178 nt9.8□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 KTR3YBR205W 1215 nt9.8□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 ICL1YER065C 1674 nt9.79□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 snR82snR82 268 nt9.79□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 SKG1YKR100C 1068 nt9.79□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 ENB1YOL158C 1821 nt9.79□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 GAT4YIR013C 366 nt9.78□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 DFR1YOR236W 636 nt9.78□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 SNT309YPR101W 528 nt9.78□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 EDE1YBL047C 4146 nt9.78□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 BUG1YDL099W 1026 nt9.78□□□□□ -0.84
TY2B-BQ12491 SFP1YLR403W 2052 nt9.77□□□□□ -0.85
TY2B-BQ12491 ILV1YER086W 1731 nt9.76□□□□□ -0.85
TY2B-BQ12491 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt9.76□□□□□ -0.85
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TY2B-BQ12491 CAN1YEL063C 1773 nt9.74□□□□□ -0.85
TY2B-BQ12491 ARG1YOL058W 1263 nt9.73□□□□□ -0.85
TY2B-BQ12491 YML012C-AYML012C-A 378 nt9.72□□□□□ -0.85
TY2B-BQ12491 RPS3YNL178W 723 nt9.72□□□□□ -0.85
TY2B-BQ12491 ADE12YNL220W 1302 nt9.72□□□□□ -0.85
TY2B-BQ12491 OPI11YPR044C 354 nt9.71□□□□□ -0.85
TY2B-BQ12491 COX20YDR231C 618 nt9.7□□□□□ -0.86
TY2B-BQ12491 SPT3YDR392W 1014 nt9.7□□□□□ -0.86
TY2B-BQ12491 YOR342CYOR342C 960 nt9.7□□□□□ -0.86
TY2B-BQ12491 LDB18YLL049W 540 nt9.7□□□□□ -0.86
TY2B-BQ12491 IRC11YOR013W 471 nt9.7□□□□□ -0.86
TY2B-BQ12491 RDN5-2RDN5-2 119 nt9.69□□□□□ -0.86
TY2B-BQ12491 RDN5-3RDN5-3 119 nt9.69□□□□□ -0.86
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