Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prrx2Q06348 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrx2Q06348 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms