Protein–RNA interactions for Protein: Q05915

Gch1, GTP cyclohydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gch1Q05915 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gch1Q05915 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gch1Q05915 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gch1Q05915 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gch1Q05915 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gch1Q05915 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gch1Q05915 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms