Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Snai1Q02085 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snai1Q02085 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Snai1Q02085 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Snai1Q02085 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Snai1Q02085 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Snai1Q02085 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Snai1Q02085 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Snai1Q02085 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snai1Q02085 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snai1Q02085 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snai1Q02085 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snai1Q02085 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snai1Q02085 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms