Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HmgcrQ01237 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HmgcrQ01237 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HmgcrQ01237 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HmgcrQ01237 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms