Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F8a1Q00558 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
F8a1Q00558 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms