Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry1P97784 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry1P97784 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry1P97784 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry1P97784 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry1P97784 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry1P97784 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry1P97784 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry1P97784 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry1P97784 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cry1P97784 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cry1P97784 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cry1P97784 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry1P97784 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry1P97784 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cry1P97784 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry1P97784 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry1P97784 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry1P97784 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry1P97784 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms