Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms