Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbx1P62878 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbx1P62878 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms