Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defa8P50706 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Defa8P50706 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defa8P50706 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defa8P50706 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defa8P50706 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defa8P50706 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Defa8P50706 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Defa8P50706 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Defa8P50706 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Defa8P50706 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Defa8P50706 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa8P50706 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa8P50706 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa8P50706 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa8P50706 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa8P50706 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa8P50706 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa8P50706 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa8P50706 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Defa8P50706 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa8P50706 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa8P50706 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa8P50706 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa8P50706 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa8P50706 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms