Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tulp2P46686 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tulp2P46686 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tulp2P46686 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms