Protein–RNA interactions for Protein: P43137

Reg1, Lithostathine-1, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg1P43137 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reg1P43137 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reg1P43137 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reg1P43137 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reg1P43137 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Reg1P43137 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reg1P43137 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reg1P43137 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Reg1P43137 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Reg1P43137 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reg1P43137 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reg1P43137 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reg1P43137 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reg1P43137 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reg1P43137 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reg1P43137 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reg1P43137 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reg1P43137 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reg1P43137 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reg1P43137 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reg1P43137 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reg1P43137 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reg1P43137 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms