Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 MRPS28YDR337W 861 nt6.74□□□□□ -1.33
SEC28P40509 PRI1YIR008C 1230 nt6.74□□□□□ -1.33
SEC28P40509 ZIM17YNL310C 525 nt6.74□□□□□ -1.33
SEC28P40509 SPE3YPR069C 882 nt6.74□□□□□ -1.33
SEC28P40509 CCT3YJL014W 1605 nt6.74□□□□□ -1.33
SEC28P40509 PPM2YOL141W 2088 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC28P40509 RGD2YFL047W 2145 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC28P40509 MKK1YOR231W 1527 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC28P40509 HED1YDR014W-A 489 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC28P40509 AGX1YFL030W 1158 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC28P40509 COS10YNR075W 1125 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC28P40509 YOL046CYOL046C 675 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC28P40509 TMA46YOR091W 1038 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC28P40509 MCP1YOR228C 909 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC28P40509 YTH1YPR107C 627 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC28P40509 ELP3YPL086C 1674 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC28P40509 FRE5YOR384W 2085 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC28P40509 CMR1YDL156W 1569 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC28P40509 GAA1YLR088W 1845 nt6.72□□□□□ -1.33
SEC28P40509 PPH21YDL134C 1110 nt6.72□□□□□ -1.33
SEC28P40509 TRS31YDR472W 852 nt6.72□□□□□ -1.33
SEC28P40509 YSC83YHR017W 1158 nt6.72□□□□□ -1.33
SEC28P40509 URA1YKL216W 945 nt6.72□□□□□ -1.33
SEC28P40509 GCN3YKR026C 918 nt6.72□□□□□ -1.33
SEC28P40509 SEC23YPR181C 2307 nt6.72□□□□□ -1.33
SEC28P40509 HOG1YLR113W 1308 nt6.72□□□□□ -1.33
SEC28P40509 EFM1YHL039W 1758 nt6.72□□□□□ -1.33
SEC28P40509 MSC3YLR219W 2187 nt6.71□□□□□ -1.33
SEC28P40509 NUP49YGL172W 1419 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC28P40509 ERP2YAL007C 648 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC28P40509 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC28P40509 YNR014WYNR014W 639 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC28P40509 ECM30YLR436C 3825 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC28P40509 GSH1YJL101C 2037 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC28P40509 YHR020WYHR020W 2067 nt6.7□□□□□ -1.34
SEC28P40509 PPH22YDL188C 1134 nt6.7□□□□□ -1.34
SEC28P40509 AAD14YNL331C 1131 nt6.7□□□□□ -1.34
SEC28P40509 OPI11YPR044C 354 nt6.7□□□□□ -1.34
SEC28P40509 TFC6YDR362C 2019 nt6.7□□□□□ -1.34
SEC28P40509 SSC1YJR045C 1965 nt6.69□□□□□ -1.34
SEC28P40509 SWD1YAR003W 1281 nt6.69□□□□□ -1.34
SEC28P40509 CUE4YML101C 354 nt6.69□□□□□ -1.34
SEC28P40509 RQC1YDR333C 2172 nt6.69□□□□□ -1.34
SEC28P40509 IRC11YOR013W 471 nt6.68□□□□□ -1.34
SEC28P40509 SEC62YPL094C 825 nt6.68□□□□□ -1.34
SEC28P40509 FCY22YER060W-A 1593 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC28P40509 RPL5YPL131W 894 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC28P40509 ASR1YPR093C 867 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC28P40509 ADH5YBR145W 1056 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC28P40509 NMT1YLR195C 1368 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC28P40509 YOR389WYOR389W 1875 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 LDB7YBL006C 543 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 PRY3YJL078C 2646 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 PEX31YGR004W 1389 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 COX15YER141W 1461 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC28P40509 HOC1YJR075W 1191 nt6.65□□□□□ -1.34
SEC28P40509 YJR107WYJR107W 987 nt6.65□□□□□ -1.34
SEC28P40509 HMS2YJR147W 1077 nt6.65□□□□□ -1.34
SEC28P40509 PUS5YLR165C 765 nt6.65□□□□□ -1.34
SEC28P40509 RRN10YBL025W 438 nt6.65□□□□□ -1.34
SEC28P40509 YBL070CYBL070C 321 nt6.65□□□□□ -1.34
SEC28P40509 JIP4YDR475C 2631 nt6.64□□□□□ -1.35
SEC28P40509 OPT1YJL212C 2400 nt6.64□□□□□ -1.35
SEC28P40509 YDR415CYDR415C 1125 nt6.64□□□□□ -1.35
SEC28P40509 DYS1YHR068W 1164 nt6.64□□□□□ -1.35
SEC28P40509 YJL144WYJL144W 315 nt6.64□□□□□ -1.35
SEC28P40509 LIA1YJR070C 978 nt6.64□□□□□ -1.35
SEC28P40509 HST2YPL015C 1074 nt6.64□□□□□ -1.35
SEC28P40509 PLB3YOL011W 2061 nt6.64□□□□□ -1.35
SEC28P40509 SLX5YDL013W 1860 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 GPD1YDL022W 1176 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 HIS1YER055C 894 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 FHN1YGR131W 525 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 CDC11YJR076C 1248 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 YKR032WYKR032W 315 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 OPI8YKR035C 642 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 YLL066CYLL066C 3618 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 KSH1YNL024C-A 219 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 YNL092WYNL092W 1203 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 BIO3YNR058W 1443 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 COQ1YBR003W 1422 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 COX10YPL172C 1389 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 GPH1YPR160W 2709 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC28P40509 EDE1YBL047C 4146 nt6.62□□□□□ -1.35
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