Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdh15P33146 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh15P33146 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdh15P33146 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms