Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hoxd10P28359 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxd10P28359 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd10P28359 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms