Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd8P23463 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxd8P23463 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd8P23463 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd8P23463 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms